機能追加などカスタマイズは可能ですか？

Python言語で構築されたスクリプトをQTMに実装できます。スタジオ独自のスケルトンやマーカーセットの実装など、ヘビーユーザーからビギナーまで、視覚的で実用的なスクリプトで自由にカスタム機能追加して運用頂けます。
https://qualisys.github.io/qtm-scripting/
また撮影をサポートするPAF（Project Automation Framework）という機構を実装する事も可能です。